📄 molecular biology

Cytoplasmic circular dsDNA is a key constituent of stress granules

تكشف هذه الدراسة أن الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ثنائي السلسلة الدائري خارج الكروموسومات (eccDNA) يشكل مكونًا رئيسيًا لنوى الحبيبات الإجهادية وهو ضروري لتشكلها أثناء استجابة حقيقيات النواة للإجهاد.

Demeshkina, N. A., Ferre-D'Amare, A. R.2026-03-15
📄 molecular biology

Photocrosslinking Activity-Based Probes to Capture the Dynamics of Ubiquitin RING E3 Ligase Interactions

قام المؤلفون بتطوير مسبار يعتمد على الربط الضوئي النشط باستخدام اليوبيكويتين المعدل لرسم خرائط والتحقق من مناطق التفاعل بين إنزيمات E2 وإنزيمات RING E3 ligase المتنوعة، وذلك لتأكيد النماذج الهيكلية القائمة وتقييم النماذج الجديدة في ظل غياب البنى البلورية.

Chandler, S. F., Tatham, M. H., Branigan, E., Nakasone, M., Makukhin, N., Ciulli, A., Hay, R. T.2026-03-15
📄 molecular biology

Sample-derived cDNA guides broad host RNA depletion for in vivo pathogen transcriptomics

تقدم هذه الورقة طريقة استنفاد لـ RNase H مسترشدة بـ cDNA مشتق من العينة، تعمل على إزالة الحمض النووي الريبوزي المضيف انتقائياً من الأنسجة المصابة لإثراء النسخ البكتيرية بأكثر من 14 ضعفاً مع الحفاظ على الـ rRNA البكتيري، مما يتيح دراسة ترانسكريبتوميات الممرضات داخل الجسم بكفاءة عالية من حيث التكلفة وحساسية مرتفعة.

Doruk, T., Sarigoz, O., Avican, K.2026-03-14
📄 molecular biology

Differential chromatin looping regulated by two GA-binding transcription factors creates an X-specific chromatin environment for dosage compensation

تكشف هذه الدراسة أن الارتباط التنافسي لعامل النسخ CLAMP فوق GAF عند تكرارات GA على كروموسوم X في ذبابة الدروسوفيلا يدفع نحو أنماط حلقية للكروماتين ثلاثية الأبعاد متبادلة حصرياً، مما يخلق بيئة محددة تستقطب معقد تعويض الجرعة لرفع مستوى تعبير الجينات النشطة.

Aguilera, J. L., Cortez, K., Segarra Alonzo, L. C., Aldana, M., Aragon Vasquez, A., Gray, C., Woodman-Sousa, M., Grive (…)2026-03-14
📄 molecular biology

ApoFLARE: a luminescent reporter for direct quantification of APOBEC3A editing activity

يقدم المؤلفون ApoFLARE، وهو تقرير مضيء مشفر جينياً يتيح القياس الكمي المباشر والقابل للتوسع والمحدد زمنياً لنشاط تحرير APOBEC3A في الخلايا الحية، متجاوزاً بذلك قيود طرق القياس غير المباشرة أو القائمة على النتائج النهائية.

Di Marco, M. V., Butler, B. L., Eggers, C. T., Hata, A. N.2026-03-14
📄 molecular biology

Transcription directs Holliday junction branch migration

تكشف هذه الدراسة أن معقد Top3-Sgs1 ينسق الهجرة المرتبطة بالنسخ لجسور هوليدي من مواقع الكسور الناجمة عن بروتين Spo11 إلى المناطق المرتبطة بالـ cohesin والناتجة عن النسخ المتقارب، حيث يتم حل العبور بشكل تفضيلي لضمان الفصل الدقيق للكروموسومات في الانقسام الاختزالي.

Powell, T. J., Brown, G. G., Allison, R. M., Harper, J. A., Neale, M. J., Gittens, W. H.2026-03-13
📄 molecular biology

Conservation of extended sequence and structure in the branchpoint-to-3' splice site region upstream of neural microexons

تكشف هذه الدراسة أن الإكسونات الدقيقة العصبية في كل من البشر والدجاج تعتمد على بنيات ثانوية للحمض النووي الريبوزي (RNA) محفوظة ومتاحة ضمن المنطقة الممتدة من نقطة التفرع إلى موقع الربط 3'، وذلك لتسهيل تجميع الجسيم الموصلي وتنظيم عملية الربط النوعي للمراحل أثناء التطور العصبي.

Randazza, A., Howe, K. E., McCoy, J. R., Hatfield, A., Doucet-O'Hare, T., Lackey, L.2026-03-12
📄 molecular biology

In garden dormouse cerebral cortex, specific transcriptional programs exist for all major phases of hibernation

تكشف هذه الدراسة أن القشرة المخية لحيوان "دراهم الحديقة" تخضع لإعادة برمجة نسخية محددة بمراحل أثناء السبات، تتميز بتنظيم جيني واسع النطاق خلال تقدم حالة الخمول، وعكس سريع ومنسق لهذه البرامج الأيضية والبروتينية أثناء مرحلة الاستيقاظ المبكر للحفاظ على السلامة العصبية.

Jakubowski-Addabbo, A., Hamberg, M. R., Gray, J., Hut, R. A., Guryev, V., Henning, R. H., Roorda, M., Lie, F. F.2026-03-12
📄 molecular biology

Molecular mechanism of coilin interaction with core snRNPs

توضح هذه الورقة الآلية الجزيئية التي يميز بها الكولين، وهو البروتين السقالي لأجسام كاجال، بين الـ snRNPs الناضجة وغير الناضجة من خلال وحدة طرفية-C ثنائية الأجزاء تتكون من منطقة ربط RNA ذات تكرار RG ونطاق شبيه بـ Tudor يرتبط تحديداً ببروتينات Sm، مما يسهل عزل المعقدات المعيبة.

Radivojevic, N., Holotova, V., Grouslova, M., Fischer, U., Stanek, D.2026-03-12
📄 molecular biology

Large-scale mutational analysis uncovers molecular mechanisms governing dual RNA functions in transposons

تستخدم هذه الدراسة تحليلاً طفرياً واسع النطاق للكشف عن كيفية موازنة الـ "IStrons" بين وظائفيها المزدوجتين المتمثلتين في قطع الحمض النووي (DNA) الموجه بالحمض النووي الريبوزي (RNA) والتشذيب الذاتي، مع تحديد نقطة تقارب جزيئية عند الطرف الأيمن للعنصر القافز وإثبات أن الاستقرار الهيكلي للحمض النووي الريبوزي الموجه يحكم المقايضة بين هذين المسارين المتنافسين.

Mortman, E. E., Sternberg, S. H.2026-03-12